La integración de los VPH-AR altera la expresión de oncogenes como Ciclina E1 (CCNE1). El incremento en la expresión de E6 y E7 de los VPH-AR se ha encontrado relacionado con la expresión incrementada del microRNA-16-1 (miR-16-1) en carcinoma cervical (CC). En otros tipos de cáncer CCNE1 es blanco del miR-16-1, pero en CC esto no ha sido reportado